故宫鼓浪屿外国文物馆
故宫鼓浪屿外国文物馆是故宫博物院在地方设立的第一个主题分馆，由厦门市政府与故宫博物院合作建设，占地面积11000平方米，建筑面积5180平方米，于2017年5月正式对外开放。鼓浪屿外国文物馆是展馆现展示文物195件（套），集中展示故宫博物院收藏的明清两代遗存至今的外国文物。
福建省源古历史博物馆
福建省源古历史博物馆位于福建省厦门市湖里区五缘湾文化展览苑B区B2栋，占地面积2万平米，建筑面积2065平米，馆内展示面积1860平米，馆藏文物4566件。我馆是经福建省人民政府文化厅《福建省文化厅关于核准成立福建省源古历史博物馆的批复》（闽文物〔2011〕124号)和民政厅《福建省民政厅关于福建省源古历史博物馆成立登记的批复》（闽民馆〔2011〕256号）批准成立的第一家综合性民办历史博物馆。
厦门市博物馆
厦门市博物馆于1983年筹建，1988年正式对外开放，旧馆原址位于鼓浪屿的八卦楼。2006年6月，经中共厦门市委机构编制委员会批准，将厦门市郑成功纪念馆、厦门市文化遗产保护中心并入厦门市博物馆，如今的厦门市博物馆由厦门博物馆主馆、郑成功纪念馆、厦门经济特区纪念馆、厦门市文化遗产保护中心、思明破狱斗争陈列馆、陈化成纪念馆、陈胜元故居七个部分组成，为全民所有制事业单位，隶属厦门市文化局管理，是一座地方综合性博物馆。
福建省九朝汇宝博物馆
福建省九朝汇宝博物馆位于厦门湖里区五缘文化展览苑A区五、六、九栋，占地面积8000平方米，可供展览、运营精品达数十万件，门类涵盖瓷器、铜器、金器、珐琅、书画、古玉、杂项、紫砂、文房四宝等，还可使用包括200余位国内外著名书画家在内的创作资源。由于藏品丰富，该博物馆展馆每3个月就会将展品轮换一次，还将不定期举办专题展览。
华侨博物院
华侨博物院是一座具有民族特色的历史博物馆，位于福建省厦门市思明南路493号西侧，建筑面积三千多平方米，截至2017年3月，有七千多件展品。该馆由著名华侨领袖陈嘉庚先生主持创办，并由侨胞和归侨捐款筹建，1956年动工，1959年5月正式开放。华侨博物院分为“华侨的产生和发展”、“解放前华侨的悲惨遭遇”、“华侨同侨居国人民的友谊”、“华侨对祖国的贡献”、“华侨社会的过去和现在”、“华侨政策的回顾”等六个部分
福建省鼓浪屿馅饼食品文化博物馆
福建省鼓浪屿馅饼食品文化博物馆于2015年8月正式对外开放，2438平方米，展示了鼓浪屿食品厂的前世今生，多维度地诠释鼓浪屿人的食品文化历史，深层次地展示鼓浪屿食品文化，成为大家认识、了解鼓浪屿食品文化的一个窗口。鼓浪屿食品厂自1956年成立至今，融合了五代人的智慧和汗水。从栩栩如生的油画再现1958年的鼓浪屿食品厂，到鼓浪屿龙头路的还原旧街景、熟悉的长条凳、再会咖啡店、添成饼家、龙头路1号的大户人家等老商铺，各式的早期食品厂所使用制饼模具、购饼批条、旧粮票、米票、菜票、蛋票、肉票等，让观众仿佛回到了那个年代。博物馆的展示墙上，展示着鼓浪屿食品厂历任厂长的介绍，以及1958年至今所获得的种种荣誉及包装创新展位。值得一提的是，还展示了1956年林朱达先生首创的第一个创新的纯朴纸质包装，到如今的各式时尚包装。
厦门奥林匹克博物馆3A景区
厦门奥林匹克博物馆是由国际奥委会和中国奥委会批准成立的中国第一家奥林匹克专题博物馆，也是国际奥林匹克博物馆联盟22家成员之一，为独立的国际化非盈利性公益机构。博物馆由国际奥委会委员、国际拳击联合会主席、世界著名建筑专家吴经国先生多年筹划、设计、创建并亲任馆长。馆内收藏了丰富的奥运会相关文物，旨在薪传奥林匹克文化、弘扬奥林匹克精神，让更多的人了解、感受和分享奥运的历史与辉煌。博物馆呈开放结构，主体建筑分三层，设计上传承了瑞士洛桑奥林匹克博物馆的理念。
厦门市同安区博物馆
同安区博物馆成立于馆1989年7月，是同安区保护和弘扬历史文化遗产的文博单位。主要职能是：宣传贯彻执行党和国家的文物保护方针、政策、法规；对文物进行收藏、保护、研究；对社会大众进行历史唯物主义、文化遗产保护、爱国主义宣传教育；承担区域内的文物考古、发掘、保护、弘扬；制定并组织实施博物馆的工作任务及发展规划，推动同安区文化遗产保护事业的发展。同安区博物馆内设机构：办公室；陈列展览宣教部；保管考古征集部。
陈嘉庚纪念馆革命遗址
陈嘉庚纪念馆属社会历史类名人纪念馆，将成为陈嘉庚文物资料的主要收藏机构，宣传教育机构和科学研究机构，充分发挥博物馆的社会教育功能和作用，使之成为人民喜闻乐见的爱国主义教育基地、终身教育课堂和文化休闲设施，为构建和谐社会服务，为推进厦门经济建设和社会发展服务。陈嘉庚纪念馆的基本陈列有两个：第一至第三展厅为《华侨旗帜民族光辉———陈嘉庚生平陈列》，第四展厅为《在陈嘉庚身边———嘉庚现象诚毅同行》。